Σύμφωνα με υποστηρικτές της εναλλακτικής ιατρικής, με την τακτική απελευθέρωση του εντέρου από τα προαναφερθέντα απόβλητα, ολόκληρος ο οργανισμός θα πρέπει να επωφεληθεί από αυτό από την άποψη της υγείας, καθώς μια «μεθυσμένη» εντερική οδός θα μπορούσε να δημιουργήσει προβλήματα όχι μόνο στο πεπτικό σύστημα, αλλά και για άλλες συσκευές και συστήματα του σώματος, με αρνητικές συνέπειες σε ολόκληρη την κατάσταση της υγείας του ατόμου.
Η εντερική αποτοξίνωση στην εναλλακτική ιατρική ασκείται μέσω ενός καθαρισμού του εντέρου που μπορεί να λάβει χώρα με την υιοθέτηση ενός συγκεκριμένου τύπου δίαιτας, με την υπόθεση συγκεκριμένων φυσικών θεραπειών και με την εκτέλεση εντερικών πλύσεων.
Παρά τον αυξανόμενο αριθμό ατόμων που προσεγγίζουν αυτές τις εναλλακτικές θεραπείες, δεν υπάρχουν επιστημονικά στοιχεία που να μπορούν να επιβεβαιώσουν τα οφέλη. Αντίθετα, η χρήση αυτών των εναλλακτικών θεραπειών μπορεί να οδηγήσει στην εμφάνιση περισσότερο ή λιγότερο σοβαρών παρενεργειών.
