Η φλεγμονή μπορεί να εντοπιστεί σε ένα ακριβές σημείο του βλεννογόνου του στόματος ή να εμπλέξει τον τελευταίο με έναν ευρέως διαδεδομένο και γενικευμένο τρόπο.
Η στοματίτιδα μπορεί να προκαλέσει διαφορετικά συμπτώματα, όλα εντοπισμένα στη στοματική κοιλότητα: πρήξιμο, ερυθρότητα, στοματικά έλκη (πληγές) και, σε ορισμένες περιπτώσεις, απώλεια αίματος. Τα σημάδια της στοματίτιδας σχετίζονται με μια αίσθηση πόνου, που συνήθως εντείνεται ενώ τρώτε, μιλάτε ή βουρτσίζετε τα δόντια.
Σε περίπτωση που η στοματίτιδα υποτροπιάσει με κάποια κανονικότητα, είναι σκόπιμο να αναλογιστούμε τους πιθανούς παράγοντες ενεργοποίησης, οι οποίοι γενικά αποτελούνται από τροφικές δυσανεξίες ή αλλεργίες, διατροφικές ανεπάρκειες (για παράδειγμα: έλλειψη σιδήρου, φολικό οξύ, βιταμίνη Β3) ή σε συνθήκες υψηλό στρες.